Omstreeks het jaar 1270 werd vanuit het toen naburige dorp Werendijke de Catharinakerk van Zoutelande gesticht. De huidige kerktoren dateert vermoedelijk uit die tijd. Het huidige kerkgebouw is in de 14e eeuw gebouwd, maar was toen bijna twee keer zo lang en eindigde in een driedelig koor. Ter hoogte van de huidige consistorie was een dwarsschip zodat het geheel een zogenoemde 'kruiskerk' was. Waarschijnlijk zijn de transepten in de Tachtigjarige oorlog (1568-1648) afgebroken, toen het dorp en de kerk behoorlijk in verval waren geraakt.

In de Tweede Wereldoorlog (1940-1945) is de kerk bij een beschieting op 2 november 1944 zo zwaar getroffen, dat de kerk niet meer te gebruiken was voor de erediensten. Daarop werd het dak van de kerk voorlopig gedicht met platen om verdere schade te voorkomen. Aan de Duinweg werd tijdelijk een noodkerk in gebruik genomen. Ondanks dat het kerkdak provisorisch was gedicht, bleek na de inundatie van Walcheren tusse 1944 en 1946 dat de schade was toegenomen. Bij de uitgevoerde restauratie werd de nieuwe consistorie meer in stijl van de kerk gebouwd, de zoldering van de kerk is verwijderd zodat het tongewelf weer zichtbaar is en de ruimte onder de toren is bij de kerk getrokken. Op 28 januari 1950 werd de vernieuwde Catharinakerk weer in gebruik genomen. 

Kerkdienst is iedere zondag om 09.30 uur.